朱慈烺也并不会，也没有足够的资源大幅投入扩充一支这样的军队，这并不能取得效益上的最大化，也不符合这个时代的战场形势。
回到眼前，军事会议上，对于那些只是叫苦不知道该如何下手，但颇为积极的部将，朱慈烺大多以鼓励的态度，让他们多和手下的军官士兵交谈。
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而那些一开口就是除了简单的旗号和军令，就不认识几个字，各种找理由推脱的，朱慈烺也没有客气，罚了这些军官一个月的饷银之后，随即让他们自己想办法解决，否则直接降职。
个人的力量终究是有限的，更不可能面面俱到，朱慈烺只有充分发挥军官和士兵的主动性，那他的军队才是不可战胜。小到各类武器的改进，大到军事战略的群策群力，都将会受益于此，而这些同样也是将来大明大军能够胜过同时代的其他军队更多的关键。
朱慈烺随之而来的军制改革不仅仅涉及到了军队的基层编制，还有高层的参谋部，他也打算借此机会搭好架子，而这次的作战总结，其中的一个目的，便是要寻找进入参谋部的苗子。
当然，这只是其中的一方面，军队的扫盲并非一朝一夕可以完成，而那是军队能够迅速更进一步的基础，朱慈烺需要将识字纳入军队晋升的考核之中，迫使军官和士兵都得抓紧学习认字。
军事会议结束之后，“忠臣祠”的准备工作也已经完成，阵亡将士们牌位的入祠时间定在了第二日。届时，朱慈烺将会领着麾下的大臣大将们，亲自主持这一仪式.
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第二日一早，驻扎在南京城内外各个大营的明军，除了各军的主要将领之外，每一营伍都按要求派了士兵代表前来参加“英烈入祠仪式”，张季等人也在其中，此时正站在武卫营士兵代表所在队列的第一排。
而他面前的站台上，面色威严的张煌言笔直站立，正在大声宣读祭文——对甲申之变以来，在淮河大战，徐州保卫战，中原战役等诸多战斗中，为抗清而牺牲的英雄典范都在其中得到了表彰。
张季就站在张煌言面前不远，占着地利，听得很清楚，那些被特别表扬的典范里面，就有几个是他也听说过的老兵，这让他心中颇为感触，甚至是有些感同身受。
等到张煌言宣读完祭文之后，军中一个军官随即大喊一声，队列一侧的数百名火枪手得令，当即朝天鸣枪，对这些为国牺牲的英雄以示告慰。
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隆重庄严的“鸣枪礼”结束之后，朱慈烺和一众大将亲自动手，将一块高达一丈，雕刻精美的纪念碑埋进了事先挖好的坑洞之中。
看着眼前的一切，纪念碑前方严整肃静的士兵代表队列中，忽然传出了接连不断的低声哽咽，纪念碑所纪念的阵亡将士中，就有他们的战友和兄弟。
等到纪念碑埋好之后，朱慈烺作为皇帝，又亲自为第一批入祠的阵亡将士上了第一柱香。
“忠臣祠”位于南京东北，风水极好的位置，以巨木为柱梁，大堂修得非常宏大气派，里面的空间也得到了充分的利用，一面面墙上灵牌竖立，层层往上，可以容纳数万灵位。
张季从来没有想过他们这些出身贫苦的士兵会受到这样的礼遇——不仅有祠堂，有灵牌，永远接受香火供奉，居然还有石碑刻字，通达上天，保佑子孙后代的福泽。
他虽然对皇帝陛下无比信服，知道“忠臣祠”就是用来供奉阵亡将士的，但却没想到会如此隆重，皇帝陛下万金之躯，居然还亲自动手了。前所未有的尊重，荣誉和强烈的归属感瞬间充满了这个已经是老兵的家伙的内心，让他的眼眶也不由得红润了起来。
朱慈烺上完香之后，借着入祠仪式，宣布了“忠臣祠”的一系列管理措施，包括每年定期的集中祭祀，阵亡将士家属的抚恤管理，养子香火继承制度的落实情况，以及烈士家属，养子今后在大明工坊，商社，海贸，军队的选拔中拥有的优先权限等等……
当然，和奖励措施一同宣布的，还有对大战期间，那些临阵脱逃的负面典范的惩罚，这也是张煌言之后要重点提及的。那些逃兵将会受到十分残酷的处罚，家属也会跟着受到拖累，而且没有丝毫缓和的余地。
而主持完“忠臣祠”的入祠仪式之后，朱慈烺又带着一众官员，专门去到了收养战争孤儿的院子中进行探望。这里面的孩子大多都是在战乱中失去了父母，甚至是所有亲属的，又或者是其他亲属无力抚养，不愿抚养，将人送来孤儿院的。
这些孩子相当大的一部分都已经记事，也知道自己的姓，所以在分配的时候，记事的孩子基本上都是找到同姓的烈士，认作养父，供奉香火，也算是两边都不为难了。而那些年纪还很小的，则是补上了另外的差额。
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