一个不起眼的巢都世界上，某个国教牧师绑架漂亮女人杀掉，把尸体防腐处理后缝成床垫，事情败露后遭到枪决。
这原本是再正常不过的刑事案件，稍加深挖就会被打成异端，然而当传到其他行星贵族耳中时，被认为帝国把刑事违法当做三害处理。
当权者谁没有犯过法？如果按照刑事案件标准，帝国所有权贵都是三害！
在混沌邪教的渲染之下，“刑事犯罪成三害”的谣言被快速传播，进一步加剧星球贵族们的担忧。
担忧、恐惧、焦虑的情绪在亚空间汇聚，被混沌邪神捕捉，然后稍加影响，这些权贵便成了混沌的信徒。
刹那间，这些世界发生叛乱，起义犹如星火燎原，蔓延帝国全境，然而帝国早有准备。
叛乱世界首先遭遇星系部队的强力镇压，恒星基地掌握着星系唯一的舰队，尽管只有轻巡级别，但足以掌握星系制宇权。
随后，星系舰队向叛乱世界发起轨道轰炸，将行星防御部队炸得七零八落，最后派出巨神兵和直属PDF支援忠诚派，快速赢得内战。
若是叛乱势力强大，与行星部队形成僵持，审判庭就会出动，死亡守望、战斗修女、灰骑士空降行星地表，对叛徒进行斩首。
若是星系舰队被策反，星系控制权丢失，则会出动守备军团，在战列舰编队下，星系轻巡舰队无法抵抗。
通过着三步走对策，在叛乱之火刚燃起的一刻，就被快速扑灭，残党只能在绝望中，等待科研船的到来。
很快，净化远征圆满完成，帝国境内的三害被肃清一空，赛义德当场决定，将净化远征常态化，每百年进行一次。
他在总结会上强调：“异端生生不息，净化燎原往复！诸位，这是一场没有尽头的战争，净化永远在路上！”
与此同时，作为对阿巴顿放绿皮的回应，侦查舰队进入恐惧之眼，前往一个名叫艾多隆的星系。
上面有着四个帝国，分别信仰四个邪神，进行着旷日持久的战争，上面人类却不知它们所谓的战争，不过是诸神间微不足道的游戏。
而艾多隆也是黑军团的兵源地，进攻现实宇宙的桥头堡。
侦查舰队准备摧毁这里！
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