日本在这里投入的二万主力战兵，战后只有三千人被俘，能逃离战场的可以说是凤『毛』麟角。临时征召的民夫更是如失去魂魄的野鬼，双目无神或呆立、或游『荡』在战场。十余万日军中有六万八千余人成为破奴军俘虏，协统付瑞阁更是给都统领张通送信，请张都统带部队尽快撤离战场，他将亲自主持善后事宜。按说付瑞阁这话有些僭越，张通既然是征夷行营大总管这些命令该由他来发出。张通从付瑞阁派人传话中，听出了部下们的不满，加上他也为 这场战役失利负责的心理，张通没有多说什么默默带领伤兵撤离战场。
对敌人从未有过怜悯之心的破奴军将士，在面对侮辱过他们兄弟尸体的敌军其报复手段永远比他们的敌人更加残酷。对于战败被俘日本人，付瑞阁下令所有被俘日本足轻坐木桩，带兵的组头们千刀万剐。至于那些没有盔甲的民夫，付瑞阁命令手下，但凡发现有伤且费『药』的伤兵与足轻同等待遇。心有恨意的破奴军官兵们，押解着俘虏拆除营寨栅栏木桩并削尖，然后把二丈长的木桩埋入泥土三尺。
一万余木桩密密麻麻铺满在阵亡破奴军阵地周围，破奴军将用血祭为阵亡的兄弟们招魂。活人坐木桩这种刑罚极为残酷，削尖的木桩从人下体『插』入腹腔，最后再从头部穿出。整个过程快的需要一天，慢的得三天才能从头部见到木桩尖刺。一般人都不会马上死亡，他们由痛苦地哀嚎到慢慢真正死亡，这种痛苦死亡令观者刺目。要是日本俘虏在把祭品『插』入木桩上但凡出现一点同情，那么他们的命运将为阵亡的破奴军将士增加新的祭品。
破奴军极度血腥手段有效震慑了所有日本俘虏，有上百人被这种恐怖的场景吓疯，享受血祭的破奴军阵亡将士们随即又多了更多祭品。观看了破奴军报复手段的日本俘虏至此成为了温顺的鸭子，他在随后行军中表现得比草原绵羊还要听话。当付瑞阁回到黑石头村主营时，左二丫再次跑到了石见银矿山，他才转运出一半的金银，还有大把的粗提纯矿石需要运出。日本南面大军几乎全军覆灭，引发了日本东、北两路大军的恐惧，他们裹足不前倒是给予了黑石头村破奴军从容转运俘虏和物资的方便。
虽然破奴军得以喘息，但日本幕府方面也在积蓄力量。德川有志虽然全军覆灭，但他能围困破奴军主力，还是让日本幕府看到了战胜破奴军的希望所在。本来丰臣秀吉就是民夫成为足轻一步步走到征夷大将军，他登上高位后就下令不允许民夫成为足轻，彻底断绝了农民成为武士的道路。这次幕府征召民夫为兵，还激发了那些有野心的小民内心地冲动，丰臣秀吉就是他们成功的榜样，日本幕府用了一个多月的时间，征召了四十多万民夫入伍。
就在日本幕府大量征召民夫对抗破奴军时，驻防西海岸黑石头村破奴军却突然撤离日本本土，再次攻占了对马岛全境。破奴军战败撤离的消息，引发日本全国的庆贺，日本幕府将军德川家光的声威由此达到顶峰。然而，屋漏偏逢连夜雨，黑石头村的破奴军撤离了，从虾夷渡海而来的蒙古铁骑却在陆奥登陆。
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