登基之后的头两天，主要是处理天启皇帝的后事。
郭可阳做为天启的“治丧委员会主任”忙的不可开交，一应事宜都要向他请示，自己不懂得还要请教黄立极等内阁学士。
天启皇帝驾崩突然，驾崩时又年轻，才二十三岁，所以别说营建帝陵了，连墓地位置都还没来得及选。内阁讨论后，奏请皇帝批准由大学士施凤来、钦天监监正叶震春、钦天监官员杨邦庆卜选帝陵，郭可阳照准。
天启的灵柩刚开始停放在乾清宫。现在新皇即位乾清宫是皇帝的寝宫，继续停放在那里肯定不合适，便移到仁智殿里停放。
八月二十七日，天启帝灵柩移至仁智殿。仁智殿俗称白虎殿，位于武英殿以北，明代皇帝死后，下葬之前梓宫灵位都在此停供。
新皇帝搬到乾清宫东暖阁居住。郭可阳召徐应元、方正化入乾清宫侍奉。因为张皇后还住在坤宁宫，搬走安置需要时间，所以王府家眷还住在原信王府。
登基之后并没有多少喜悦，郭可阳却陷入了巨大的危机感中，有时望着空荡荡的大殿内心极度缺乏安全感。
他知道现在自己虽然名义上做了皇帝，但是并没有坐稳。魏忠贤一党在朝中经营了七年，现在内宫外朝都是阉党。不清除阉党自己就不可能完全掌握权力，不完全掌握权力，那么自己所设想的所有改革，成功的可能性都是零。
而崇祯年间正是明末各种矛盾大爆发的时期。自己马上就要面对后金在崇祯二年的入侵，也就是着名的“己巳之变”。后金将把京畿地区搅得残破不堪。
陕西的灾害和流民潮也即将爆发，并逐渐成燎原之势，搅得大明狼烟四起，最终逼得崇祯吊上了煤山上的歪脖子树。
想到煤山上的歪脖子树，不由的引发了郭可阳的好奇心。于是第二天一早，郭可阳便带着王承恩去爬煤山。
煤山在紫禁城正后方，并不高，只有约四十米，是挖掘紫禁城护城河和太液池、南海的泥土堆积而成。煤山只是俗称，正名叫做万岁山。据说，明初朝廷在景山堆煤，以防元朝残部围困北京引起燃料短缺，因此该山又称“煤山”。
不多时爬到山顶，郭可阳有些气喘，看来这个身体确实需要锻炼了，转头看看王承恩倒是没什么反应。在山顶上转了一圈，看到好几棵歪脖子槐树，也不知道最后崇祯上吊的是哪一棵。王承恩有些疑惑的跟在后面，搞不清楚皇帝在搞什么名堂。
找不到便不找了，郭可阳索性在山顶选了个视野开阔的地方看风景。
煤山是全城的制高点，这个时代没有什么高层建筑，站在煤山顶上可以俯瞰全城。
望着北京城如棋盘般方正的布局，眼下金碧辉煌的紫禁城，还有远处高大延绵的北京城墙。一阵晚秋的凉风吹来，吹去了登山时身上的燥热，不仅让郭可阳心情舒畅，大脑也豁然开朗。
站在山顶，郭可阳逐渐理清了这些天自己脑海中繁杂的思绪。
自己现在面临着三个大的威胁：一是魏忠贤一党；二是后金以及原崇祯二年、现神武二年即将到来“己巳之变”；三是以李自成张献忠为代表的农民军。
先说魏阉一党，这个是当下就杵在自己面前的最现实、最紧迫的威胁。魏忠贤必须杀掉，其党羽也必须除去。这不仅仅因为魏忠贤在天启朝权势滔天，做了许多恶事。而是因为魏忠贤现在是他神武皇帝的权力之敌，不清除掉魏阉一党，自己就不可能大权在握。
魏忠贤是天启的心腹不是他神武的心腹，是天启给了魏忠贤及其党羽权力，他们也只会对天启帝死心塌地。至于自己这个新皇帝无论自己怎样加以笼络，魏阉一党都绝不可能像对待天启那样忠顺的。
如果说天启帝在位时魏忠贤是天启的一条好狗，那么现在的魏忠贤就是他神武帝卧榻之侧的一条别人家的恶犬，这场景想想都恐怖。
除掉魏阉一党，大权在握，这样才能够形成接下来一切改变的基础。否则自己就只是个空架子皇帝，甚至哪天不小心“被落水”都有可能。
至于除掉的办法，郭可阳深思熟虑后，还是决定采用历史上崇祯的策略。毕竟那条路经过实践检验走得通，而且整个过程很平顺，没有波澜。那就是先稳住魏忠贤，麻痹他，等到时机成熟再徐徐图之。
其次是后金的威胁，以及神武二年即将到来“己巳之变”，该如何应对。
己巳之变极大的打击了明王朝的威信，让后金看到了明王朝的虚弱与无能。
历史上皇太极带着满蒙骑兵在京畿之地纵横驰骋、蹂躏长达半年时间，明朝居然无可奈何，勤王的军队悉数被击败。
而己巳之变中勤王的明军边军精锐，或是被后金击败而溃散、或因缺粮缺饷自行溃散。这些溃散的边军精锐不敢回营，大多为匪为盗，后来又加入农民军，实际成为之后明末农民起义军的核心力量。
尤其是李自成、张献忠等流寇的老营，大多都是由溃散或者逃亡的边军精锐组成。据有些史料记载，李自成就在这一时期进京勤王的甘肃边军中，在勤王途中部队缺饷，主将克扣不发，于是引发兵变，李自成从此走上了埋葬大明朝的道路。
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