黑皇后(The Black Queen)
对于这名被称作“黑皇后”的同行人士并无太多确定情报。所有的报告都宣称此人是一名叫做Alison Chao的女性，且是研究员Dr.██████ Gears 在被召入基金会前与██████ ███ Chao所生的女儿。此人具有极高智力和行动力，且对基金会组织、活动、收容事物都具有极为广泛的了解，并已经多次成功突破基金会安保。从报告看此人与基金会已知的几乎所有相关组织、部分地区政府和大部分世界性政府组织都有所联系。
对黑皇后的活动和行动动机存在着内容相互矛盾的报告。在部分报告中，此人被描述为极度恶毒、嗜杀、具有破坏倾向。但在另一些报告中，此人却又被描述成热衷慈善、并会秘密地协助基金会（这一点和Nobody极为相似）。无论如何，由于此人曾造成过严重的收容突破，她将被视作极度危险。
某些情报来源宣称这位黑皇后其实就是蛇之手的领袖L.S.，L.S. 这个名字的含义其实是"小姐（Little Sister）". 这些情报源宣称黑皇后以L.S的身份进行慈善活动，或者说她对蛇之手的操控要远甚于其他相关组织。以上这些信息均未得到证实。
少部分报告宣称黑皇后与某些同样自称“黑皇后”的超维度个体有所关联。这些报告称“小姐”是这些皇后们用来自称的代号，她们会在目标一致时进行合作和情报共享。当前未知这些报告所言的内容在多大程度上是真实的。
混沌分裂者(The Chaos Insurgency)
分裂者是从基金会分裂出去的一个机构,在1924年由一个擅离职守并携带数个高价值SCP项目离开的外围组织所建立。在那之后，分裂者成为世界舞台上的另一个重要角色,为了获得它自己的利益而使用SCP物品，并巩固自己在全球的权力基础。分裂者除了SCP项目以外，也运作武器流通和情报收集业务。
它利用第三世界国家的独裁制度，经常像基金会使用D级人员那样使用这些国家的人口进行研究。因此，它一直使这些国家保持赤贫和内战状态，这样它才能继续进行激进的实验，并更容易取得人力资源，以及和叛军阵营进行的有利可图的业务。
分裂者持有的大部分SCP目前未知，而那些已知的，最引人注目的是“Staff of Hermes”，这个SCP可以改变任何它所触及的物质的物理和化学属性。以及“Bell of Entropy”，取决于它所轰击的地方，该SCP可以造成各种破坏性影响。所有这些SCP物品最初都花费了基金会不小的代价来取得，而现在都被分裂者的创始人所偷取。同时分裂者也已知和SCP-355和SCP-884有所联系。
分裂者的主要基地和领袖目前未知。该组织对基金会持直接对抗态度，与基金会有数次冲突。所有人员应注意来自分裂者的可能的袭击，恐怖企图和间谍行动，并须报告任何关于其所属人员的任何异常举动。
破碎之神教会(The Church of the Broken God)
在发现并回收SCP-882不久后，数名该“教会”的成员前来并要求归还“神之心”。其首领是Robert Bumaro，他们是一群狂信者，他们相信大部分SCP物品是“神”在创造宇宙之后碎裂成的碎片。通过将“神”恢复到完整状态，他们同时也将获得神性。自从第一次接触后，另外三个“神”的关键部件被暂时证实了：SCP-217，SCP-271以及SCP-1139。其中一个献身于教会的宗派建造了SCP-808。
他们对于基金会有高度敌意，宣称基金会是“异教徒”，试图消灭基金会人员并突破SCP物品收容设施。目前仍不知道他们如何检测到SCP物品，不过他们被证实对于寻找SCP物品拥有可怕的准确度。另外，他们也被证实拥有抵抗SCP心理影响的能力，特别是SCP-882和它的“心理诱惑”。
教会同时被视为基金会和SCP物品的威胁。该组织成员应被强行拘留，或者由基金会特工用任何必要手段消灭。
Wondertainment博士(Doctor Wondertainment)
Wondertainment博士是个人还是组织目前未知。已知的只有Wondertainment博士有能力制造主题是儿童玩具的超自然物品和个体。
其与工厂的联系目前仍旧是猜测和未经证实的。
工厂(The Factory)
关于工厂的已知信息非常少，似乎他们有能力制造超自然物品——而且他们似乎拥有量产的技术。
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