以旅顺口门为界，口东5座、口西4座，从东至西分别为：老蛎嘴后炮台、老蛎嘴炮台、摸珠礁炮台、黄金山副炮台、黄金山炮台、老虎尾炮台、威远炮台、蛮子营炮台、馒头山炮台。其中除老蛎嘴炮台为穹窑式外，其余均为露天炮台，共配置火炮58门，其中200mm口径以上9门。以后又陆续增建炮台4座，增添炮位23门。
从1889年起，又环绕旅顺背后修筑陆路炮台，共计17座，炮位78门。与此同时为掩护旅顺后路，兼防金州，又在大连湾修筑海岸炮台5座，陆路炮台1座，炮位24门。
在此期间，李鸿章因旅顺船坞工程进展缓慢，于1887年转包给法国人德威尼承建，1890年11月9日竣工，丁汝昌、周馥等人前往验收，亚洲第一军港旅顺基地正式建成。
威海卫基地：威海卫基地由于资金等方面的原因从1887年才开始全面建设，由于开工较晚，其设计建造比之旅顺基地更加先进。
至1890年共建成北帮(威海北岸)炮台3座(其中北山嘴、祭祀台炮台均为上下三层的大型炮台)，南帮(南岸)炮台3座，刘公岛炮台6座(东泓、南嘴、迎门洞、旗顶山、公所后、黄岛)，日岛炮台1座。
1891年其又在威海卫后路修建陆路炮台4座，整个威海卫炮台群，共配置大小炮位167门，各炮台建造极为坚固，所配火炮多为德国克虏伯后膛巨炮，此外在刘公岛和日岛上还分别建造了地阱炮，“其炮以水机升降，见敌则升炮击之，可以圆转自如，四面环击。
燃放之后，炮身即借弹药之座力退压水汽，复还阱中”，这种地阱炮射程远、威力大，军舰一旦被其击中则必沉无疑。
初炮台群外，所有配套的后勤设施如铁码头、船坞、海军医院、海军公所等也相继建成，由此构成威海卫庞大的海军基地体系。
随着旅顺基地和威海卫基地的建成，旅顺成为了北洋水师的维护、修理基地，威海卫则成为北洋水师的永久驻军。
舰队象征：清朝时，中国并没有现代意义上的国旗、军旗，最初的海军军旗设计来自于阿斯本-李泰国舰队时期由李泰国所设计的三角黄底青龙旗，后被北洋海军沿用。1880年代改为正方形。
海军章程颁布后，遂正式成为最早的具有。
自甲午战争战败后，这首军歌就湮没于中国的历史之中。中国海军史研究会会长陈悦在英国的外交档案馆资料中发现了北洋军歌，才把这首歌重新带回国内。
经过对原曲谱的整理后，军内资深音乐家雪野按照现代方式进行了谱曲，这首军歌得以焕发新生，《北洋海军兴亡史》中得到展现。
军规：北洋水师成军后拟定《北洋海军章程》，奕譞与李鸿章奏请旨批准。内容包括船制、官制、升擢、事故、考校、俸饷、恤赏、工需杂费、仪制、钤制、军规、简阅、武备等相关事项。
命名涂装清朝海军军舰的命名，主要是将同级或同类的战舰，以一个字(即字号)贯穿各舰的舰名，而舰名通常取威武之词，如“定远”、“镇远”、“登瀛洲”等。
1875年北洋水师
主要战斗：
丰岛海战：1894年7月21日，李鸿章派遣大同总兵卫汝贵、提督马玉昆率领清军搭乘轮船从大沽口出发，至鸭绿江大东沟登陆。
期间，北洋水师的“济远”、“广乙”和“威远”三艘军舰从威海卫出海护航，另派小型炮舰“操江”运载饷银军用物资，和另一艘租用英国的运兵商船“高升”同行。
但是，“操江”和“高升”的开船日期被日本间谍得知，并发电报报告了日军大本营。
日军大本营在得到情报后，派遣日本联合舰队第一游击队的“吉野”、“浪速”、“秋津州”航行至北洋水师经过的海面，伺机发动袭击。
7月23日，北洋海军舰只抵达牙山。无防护巡洋舰“威远”由于战力单薄，被先派回国。
7月25日凌晨，“济远”和“广乙”出发回国，在清晨5点，遭遇到了日本联合舰队的这3艘快速巡洋舰。日本军舰采用“一舷齐射”的战术，向中国军舰猛烈开火。
“济远”和“广乙”均遭受了猛烈的炮击，船体损伤严重。交战中，“济远”的大副、二副全部阵亡，随即管带方伯谦下令撤退。
“广乙”在撤出战斗后，在朝鲜西岸的十八家岛搁浅。后为日军击毁。
“济远”在撤退中遭到了日舰“吉野”的追击，期间，管带方伯谦悬挂了白旗和日本军旗，希望日军不要继续追击。
但是日军认为“济远”虽然悬挂的白旗，但是并未停止航行，所以在并没有停止追击。这时，“济远”舰上水手自发组织了反击，并击中了“吉野”。“
济远”摆脱了“吉野”的追击，逃回了中国。木质炮舰“操江”随即被“秋津州”拦截后俘虏，船上的饷银和物资均被日军截获。
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