新一代领导者率队前去探查，竟发现是暗影先锋残党联合其他黑暗势力重组归来。他们掌握了一种新型的反物质技术，可以抵消联盟大部分现有武器的攻击。
联盟一时陷入苦战，节节败退。就在这时，有人想到艾克曾经留下的关于多种能源融合的理论手稿。科学家们日夜钻研，终于开发出一种全新的超级武器，它能产生多元能量场，克制反物质技术。
联盟带着新式武器重新投入战斗，一举扭转战局。当最终胜利来临，所有人都明白了艾克的先见之明以及传承精神的重要性。此后，联盟更加重视先辈经验的传承，并将艾克的理念深深融入联盟发展的根基之中，时刻警惕着宇宙中的黑暗势力，守护宇宙的和平与秩序。
经此一役，宇宙联盟更加意识到自身不能仅仅依赖现有的科技成果。于是，联盟高层决定加大对宇宙奥秘探索的投入，不仅仅是科技方面，还有文化、历史等多方面的研究。
他们派遣使者前往各个星球收集古老传说和文献资料，希望从中找到更多对抗黑暗势力的方法或者提升自身力量的启示。其中一队使者到达一个偏远星球时，发现了一块神秘石碑。石碑上刻满了奇怪符号，经解读发现，这竟是远古时期一个超级文明留下的警告，提及一种潜藏于宇宙缝隙间的黑暗存在，比之前遭遇的所有黑暗势力加起来还要恐怖。
这个消息传遍联盟，引起轩然大波。但大家并未恐慌，反而激发了更强的斗志。他们以艾克的精神为指引，开始着手研究如何探测及防范这种潜在的威胁。年轻的科学家们夜以继日，联盟各处充满紧张又积极向上的氛围，都为迎接下一轮挑战做好充分准备。
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