孝灵皇帝下中平六年（公元189年，己巳年）
春天，二月，王国的部队疲惫不堪，就解除对陈仓的包围离开了，皇甫嵩见状就进兵攻打他们。董卓说：“不行啊。兵法上说，对陷入绝境的敌人不要逼迫，对急于回家的敌军不要追击。”皇甫嵩说：“不是这样。之前我不进攻，是为了避开他们的锐气；现在进攻，是等他们士气衰落。我们要打的是疲惫之师，又不是急于回家的队伍；王国的人马都在逃跑，毫无斗志，我们以严整之师攻打混乱之军，他们算不上陷入绝境的敌人。”于是皇甫嵩独自率兵追击，让董卓在后面掩护。连续作战后，把王国的军队打得大败，斩杀了一万多人。董卓又惭愧又恼恨，从此和皇甫嵩结下了仇怨。韩遂等人一起废掉了王国，劫持了前信都令汉阳人阎忠，让他统领各部。阎忠后来病死了，韩遂等人开始逐渐争夺权力利益，还互相残杀，势力因此慢慢衰落。
幽州牧刘虞到任后，派使者到鲜卑部落，向他们说明利害关系，要求他们送上张举、张纯的首级，还承诺给予丰厚的奖赏。丘力居等人听说刘虞来了，很高兴，各自派翻译来表示愿意归附。张举、张纯逃出塞外，其余的人都投降或散去了。刘虞上奏请求撤掉各屯兵，只留下降虏校尉公孙瓒，率领一万步兵和骑兵驻扎在右北平。三月，张纯的门客王政杀了张纯，把首级送给刘虞。公孙瓒一心想彻底消灭乌桓，而刘虞想用恩德和信义来招降他们，两人因此产生了矛盾。
夏天，四月丙子日初一，发生日食。
太尉马日磾被免职；朝廷派使者到幽州就地任命刘虞为太尉，封容丘侯。
蹇硕忌惮大将军何进，就和各位常侍一起劝说皇帝，派何进往西去攻打韩遂，皇帝听从了他们的建议。何进暗中知道了他们的阴谋，就上奏请求派袁绍去召集徐州、兖州的兵力，等袁绍回来后再往西进军，借此拖延出发的日期。
当初，皇帝好几个皇子都夭折了，何皇后生的儿子刘辩，被送到道士史子眇家抚养，称为“史侯”。王美人生的儿子刘协，由董太后亲自抚养，称为“董侯”。大臣们请求立太子，皇帝觉得刘辩为人轻佻，没有威严的仪态，想立刘协为太子，但一直犹豫不决。恰好皇帝病重，就把刘协托付给蹇硕。丙辰日，皇帝在嘉德殿驾崩。蹇硕当时在皇宫内，想先杀掉何进，然后拥立刘协为帝，就派人去请何进进宫，说要一起商议事情，何进接到消息就乘车前往。蹇硕的司马潘隐和何进早就相识，他迎接何进时，用眼神向何进示意有危险。何进大惊，急忙从小路骑马赶回军营，带兵进驻百郡邸，然后称病不进宫。戊午日，皇子刘辩即皇帝位，年仅十四岁。尊称何皇后为皇太后，太后临朝处理政事。大赦天下，改年号为光熹。封皇弟刘协为渤海王，刘协当时九岁。任命后将军袁隗为太傅，与大将军何进一起参录尚书事。
何进掌握朝政大权后，对蹇硕之前算计自己的事怀恨在心，暗中谋划着要杀掉蹇硕。袁绍通过何进的亲信门客张津，劝说何进把所有宦官都杀掉。何进因为袁氏家族世代尊贵受宠，而且袁绍和他的堂弟虎贲中郎将袁术都被天下豪杰所归附，所以很信任他们，并且重用他们。何进又广泛征召有智谋的人士，像何颙、荀攸以及河南人郑泰等二十多人，任命何颙为北军中候，荀攸为黄门侍郎，郑泰为尚书，把他们当作自己的心腹。荀攸是荀爽的侄孙。蹇硕心里疑虑不安，就给中常侍赵忠、宋典等人写信说：“大将军兄弟把持国家政权，如今他们和天下的党人谋划着要诛杀先帝身边的人，消灭我们这些宦官，只是因为我掌管着禁军，所以他们才暂时犹豫不决。现在我们应该一起关闭宫门，赶紧把何进抓起来杀掉。”中常侍郭胜，是何进的同郡人，何太后和何进能得到尊贵和宠幸，郭胜出过力，所以他亲近何家。郭胜和赵忠等人商议后，没有听从蹇硕的计策，反而把蹇硕的信拿给何进看。庚午日，何进让黄门令去逮捕蹇硕，并把他杀了，然后就统领了蹇硕的禁军。
骠骑将军董重，和何进在权势上互相倾轧，宦官们扶持董重作为党援。董太后每次想要干预政事，何太后总是加以阻拦。董太后生气地骂道：“你现在这么张狂，不就是仗着你哥哥吗！我要是让骠骑将军砍了何进的头，就跟翻个手掌一样容易！”何太后听说后，就把这话告诉了何进。五月，何进和三公一起上奏说：“孝仁皇后（董太后）派前中常侍夏恽等人与州郡勾结，聚敛财物，所得都放进了西省。按照旧例，藩王的王后不能留在京城，请把她迁回本国的宫中。”奏章被批准了。辛巳日，何进派兵包围了骠骑将军府，逮捕董重，免去他的官职，董重自杀。六月辛亥日，董太后又忧虑又恐惧，突然去世。从此民间百姓不再归附何氏。
辛酉日，把孝灵皇帝安葬在文陵。何进为了防备蹇硕的同党阴谋报复，称病不进宫参加丧礼，也不去送葬。
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