永兴元年（公元304 年，甲子年）
春天，正月丙午日，乐广因为忧心忡忡，去世了。
长沙厉王司马乂跟大将军司马颖打了好几仗，每次都把司马颖打败，前前后后杀了、俘虏了六七万人。而且司马乂对皇帝一直恭恭敬敬，礼数周到。但城里的粮食一天比一天紧张，不过士兵们却没有背叛的心思。张方觉得洛阳一时半会儿攻不下来，就想撤回长安。可东海王司马越担心这事儿搞不定，癸亥日那天夜里，他偷偷跟宫里的将领们一起，把司马乂抓起来，送到别的官署去了。
甲子日，司马越禀告皇帝，让皇帝下诏免去司马乂的官职，把他关到金墉城。同时宣布大赦天下，改了年号。城门打开后，宫里的将士们看到城外敌军兵力也不咋强，就后悔了，又想着把司马乂抢出来，继续抵抗司马颖。司马越害怕了，就想杀了司马乂，断了大家的念想。黄门侍郎潘滔说：“别杀，自然会有人收拾他。”于是司马越就派人偷偷告诉了张方。丙寅日，张方从金墉城把司马乂带走，到了军营，把司马乂用火烤死了。张方的士兵们看到这场景，都忍不住掉眼泪。
这之后，公卿大臣们都跑到邺城向司马颖请罪。大将军司马颖进了京城，之后又回到邺城镇守。皇帝下诏任命司马颖为丞相，还让东海王司马越兼任尚书令。司马颖派奋武将军石超等人，带着五万士兵，驻扎在京城的十二个城门口。宫里那些他看不顺眼的人，司马颖都给杀了，还把宫里原来的卫兵全都换了。他又上表推荐卢志当中书监，把卢志留在邺城，让他参与丞相府事务。
河间王司马颙把军队驻扎在郑地，给东边的军队助威。听说刘沈起兵了，他就赶紧回到渭城镇守，还派督护虞遵夔在好畦迎战。结果虞遵夔吃了败仗，司马颙害怕了，退回长安，急忙召张方回来。张方从洛阳抢了一万多官家和私人的奴婢，往西撤。军队里没吃的，就把人杀了，混着牛马肉一起吃。
刘沈渡过渭水，驻扎下来，跟司马颙交战，司马颙老是输。刘沈派安定太守衙博、功曹皇甫澹，带着五千精兵去偷袭长安，打进城门后，一路拼杀，都到司马颙的营帐前了。可惜刘沈的后续部队来晚了，冯翊太守张辅看到他们没有后援，就带兵从侧面攻击，把衙博和皇甫澹杀了，刘沈的军队就这么败了，只能收拾剩下的士兵撤退。张方派他的将领敦伟夜里去袭击刘沈，刘沈的军队被吓得大乱，刘沈带着手下往南跑，结果被追上抓住了。刘沈对司马颙说：“朋友之间的恩情轻，君臣之间的大义重。我不能违抗天子的诏令，不能只看势力强弱就苟且偷生。我起兵那天，就料到自己会死，就算被剁成肉酱，我也心甘情愿。”司马颙气得不行，先拿鞭子抽他，然后把他腰斩了。新平太守，江夏的张光之前经常给刘沈出主意，司马颙把他抓起来质问，张光说：“刘雍州要是听了我的主意，您哪能有今天！”司马颙觉得他挺有胆量，就拉着他一起喝酒聊天，还上表推荐他当右卫司马。
罗尚逃到江阳后，派人向朝廷上表说明情况。皇帝下诏让罗尚暂时统领巴东、巴郡、涪陵，负责征收军粮赋税。罗尚派别驾李兴去找镇南将军刘弘借粮食，刘弘的下属觉得运输道路又远又难走，而且荆州自己也缺粮，就只想给罗尚五千斛零陵米。刘弘说：“天下都是一家人，彼此没什么区别。我现在给他粮食，就不用担心西边的事儿了。”于是给了罗尚三万斛米，罗尚靠这些粮食才得以生存。李兴想留下来当刘弘的参军，刘弘直接把他的手版夺过来，打发他走了。刘弘又派治中何松带兵驻扎在巴东，作为罗尚的后援。那时候，到荆州的流民有十多万户，他们出门在外，又穷又困，好多人当了盗贼。刘弘给他们分了大量田地和种子，选拔有才能的人，根据他们的能力安排职务，流民们这才安定下来。
二月乙酉日，丞相司马颖上表，请求废掉皇后羊氏，把她关在金墉城，还把皇太子司马覃废为清河王。
陈敏跟石冰打了几十场仗，石冰的人马是陈敏的十倍，但陈敏每次出击都能获胜，最后和周玘一起在建康攻打石冰。三月，石冰往北逃跑，投奔封云，结果封云的司马张统把石冰和封云都杀了，然后投降。扬州和徐州就此平定。周玘和贺循解散了自己的队伍，回家去了，也不提功劳和赏赐的事儿。朝廷任命陈敏为广陵相。
河间王司马颙上表，请求立丞相司马颖为皇太弟。戊申日，皇帝下诏，封司马颖为皇太弟，都督中外诸军事，丞相的职位不变，同时大赦天下。皇帝的车马、服饰、用具等都搬到了邺城，一切制度都仿照魏武帝曹操那时的旧例。任命司马颙为太宰、大都督、雍州牧；前太傅刘实当太尉。刘实因为年纪大，坚决推辞，不肯接受任命。
皇太弟司马颖越来越奢侈，宠信的小人掌权，搞得大家都对他很失望。司空东海王司马越，跟右卫将军陈眕，还有长沙王原来的将领上官巳等人，商量着要讨伐司马颖。秋天，七月丙申朔日，陈眕带兵冲进云龙门，拿着诏书召集三公、百官和宫里的人，宣布戒严，要讨伐司马颖，石超吓得赶紧逃到邺城。戊戌日，宣布大赦天下，恢复皇后羊氏和太子司马覃的地位。己亥日，司马越带着皇帝向北出征，司马越担任大都督。还征召前侍中嵇绍到皇帝身边。侍中秦准对嵇绍说：“这次去，生死难测，你有没有好马？”嵇绍严肃地说：“臣子护卫皇帝，生死都得跟着，要马有什么用！”
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