回到木叶后，雨崎被安置在靠近南贺川的一处特殊疗养所，由静音带领的医疗班二十四小时监护。优化后的咒印稳定运转，不仅不再危害他的生命，反而缓慢滋养着他原本瘦弱的身体，甚至让他体内开始产生微弱却纯净的水属性查克拉。
卡卡西则将全部精力投入到了对自身变化的适应和探索中。与那片浩瀚意识海的短暂连接，以及左眼窝内稳定下来的新生能量，为他打开了一扇全新的大门。
他不再执着于恢复失去写轮眼后的战力，而是开始潜心研究自身与“水”的共鸣。
首先发现的是查克拉量的巨变。虽然他的经脉宽度似乎没有根本性的改变，限制了他瞬间输出的查克拉上限，但他左眼窝连接的那片“海洋”，仿佛成了一个无穷无尽的后备能源！只要他身体能承受，查克拉就能近乎无限地缓慢补充！这意味着，持久战对他将不再是噩梦，而是优势！
其次，是对水遁的极致亲和。以往需要复杂结印和大量查克拉才能施展的高级水遁，现在他只需心念微动，甚至无需结印，周围的自然水汽就会主动响应他的呼唤，凝聚成形态各异的水遁术！威力、规模、控制精度，都提升了数个档次！仿佛他不是在“施展”水遁，而是在“引导”水流本身。
他甚至开始尝试将水的形态变化融入白牙刀术。薄薄的水流如同最锋利的刃缠绕在短刀上，时而化为坚韧的水盾格挡，时而变为突刺的激流，时而又散作迷惑敌人的浓雾……一种属于旗木卡卡西独有的、柔韧而变幻莫测的战斗风格正在逐渐成型。
凯成为了他最好的陪练。面对卡卡西那层出不穷、仿佛永不枯竭的水遁骚扰和诡异刀术，即使是开启了六门的凯也感到无比棘手。
“卡卡西！你这家伙！越来越像滑溜溜的泥鳅了！不过这才是青春的挑战啊！”凯在一次被高压水炮冲飞后，湿淋淋地爬起来，反而更加兴奋。
除了修炼，卡卡西大部分时间都泡在木叶的藏书室和最机密的封印之书阅览室，寻找一切关于“契约之地”、“海之试炼”以及古老水之传承的记载。线索寥寥，大多语焉不详，仿佛被人为地抹去。唯一能确定的，那个水流漩涡的符号，历史远比忍者村体系更为悠久。
期间，水门和鹿久多次找他谈话，一方面是关心他的状态，另一方面则是探讨云隐的动向和那个神秘的“龙之巢”。
“根据暗部最新情报，云隐内部似乎因为这次计划的连续失败产生了分歧。四代雷影依旧强硬，但以土台为首的部分顾问开始质疑这种激进研究的风险。”水门将一份加密文件递给卡卡西，“另外，我们安插的线人拼死传出消息，‘龙之巢’似乎并非一个具体地点，而更像是一个……异空间或者说能量维度的人口，与通灵圣地的原理类似，但层次更高。开启它需要巨大的能量和特定的‘钥匙’。”
卡卡西心中一动，看向水门：“雨崎……”
“嗯。”水门面色凝重，“他很可能是钥匙之一，或者说是钥匙的载体。云隐将他送到你面前，绝非偶然。他们或许无法掌控他体内的咒印，于是想借木叶之手‘培育’它，甚至……借你之手找到‘龙之巢’的入口。”
鹿久接口道：“所以我们现在的策略是，以静制动。保护好雨崎，加快对你的新能力和那种未知契约的研究。只要我们掌握得比他们多，比他们快，就能占据主动。”
卡卡西点头表示明白。这无疑是一场与时间赛跑的暗战。
这天深夜，卡卡西独自一人来到南贺川边，尝试进行更深层次的冥想，沟通那片浩瀚的意识海。清凉的水汽包裹着他，左眼窝内的能量平静流转。
渐渐地，他的感知再次延伸出去，顺着水流，超越木叶，感知到了更遥远的水脉。这一次，他没有感受到那个宏大的意念，却捕捉到了一丝极其微弱、却带着熟悉邪恶气息的能量波动——是雷螭的能量残留！它似乎附着在某条地下水脉中，正向着某个方向缓慢汇聚！
卡卡西猛地睁开眼！
云隐并没有放弃！他们无法从空中接近，竟然转而从地下着手！他们可能在利用遍布大陆的水脉系统，悄悄汇聚雷螭的能量，为开启“龙之巢”做准备！而汇聚的地点……
他立刻回家铺开大陆水脉分布图，根据刚才感知到的能量流动方向进行推算。最终，他的手指点在了地图上的一个位置——远离五大国中心、位于茫茫大海之中的一座孤岛！
波之国！
那里水脉交汇，人烟稀少，且远离各大忍村视线，是进行秘密行动的绝佳地点！
不能再等待了！必须主动出击！
卡卡西立刻前往火影办公室，将自己的发现和推测报告给水门。
水门看着地图上的波之国，沉思良久。
“你的推断很有道理。云隐很可能在波之国设置了秘密基地。但是，卡卡西，你现在的能力虽然特殊，但独自前往风险太大。我会立刻派出一支暗部小队前往侦察。”
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