阳光透过茂密的树冠洒在通往缘朱市的林间小路上，小智正用洛托姆手机查看着地图。
“按照这个速度，今天傍晚应该就能到达缘朱市了。”黑蓝相间手机壳的洛托姆飘在空中，屏幕上显示着不断闪烁的光点。
“皮卡！（太好了！）”皮卡丘站在小智肩头，尾巴轻轻摇晃。
突然，前方的灌木丛剧烈晃动起来，一个紫色的身影“嗖”地窜出，差点撞上走在最前面的小刚。
“哇啊！”小刚敏捷地往旁边一跳，灰色手机壳的洛托姆立刻飞到他面前，“检测到野生阿利多斯！危险等级：中等！”
“毛球，用念力拦住它！”一个清脆的女声从树林深处传来。紧接着，一只毛球跳了出来，双眼发出蓝光，正在逃窜的阿利多斯顿时被定在了半空中。
小优的绿色洛托姆迅速扫描：“训练家识别中...是浅红道馆馆主阿桔的妹妹阿雅小姐！”
从树后走出的少女穿着改良版的忍者服，腰间别着几个精灵球。她看到小智一行人，眼睛一亮：“咦？这不是小智吗？”
“阿雅小姐！”小智惊喜地叫道，“好久不见！你怎么会在城都地区？”
阿雅指挥毛球将挣扎的阿利多斯轻轻放在地上，那只蜘蛛宝可梦立刻钻进了草丛深处。“这只阿利多斯偷吃了学院储存的树果，我正在追它。”她擦了擦额头的汗，“你们来得正好，要不要来我们忍者学院参观？就在前面不远。”
“忍者学院？”小刚眼睛一亮，“就是阿桔先生提到过的那个...”
“没错，哥哥年轻时也在这里修行过。”阿雅自豪地说，“现在由我们的师父担任学院长。”
小优好奇地凑过来：“听起来很有趣！我们能去看看吗？”
“当然可以！”阿雅做了个“请”的手势，“跟我来吧。”
穿过几条隐蔽的小径，一座隐藏在瀑布后的传统建筑出现在众人面前。木质的大门上刻着“忍”字，周围种满了各种药草。
“哇...”小智睁大了眼睛，“完全看不出这里有这么大的建筑！”
“这就是忍者的隐蔽之术。”阿雅神秘地笑了笑，推开大门，“师父！我带客人来了！”
一位白发苍苍的老人盘腿坐在庭院中央的垫子上，身边围着几只叉字蝠和末入蛾。他睁开一只眼睛：“哦？这不是真新镇的小智吗？阿桔经常提起你。”
小智惊讶地指着自己：“阿桔先生提起我？”
“他说你是少数几个能看穿他替身术的训练家。”老人缓缓站起身，“既然来了，要不要体验一下忍者的修行方式？就当是...一天的学员？”
小智、小刚和小优交换了一个兴奋的眼神，异口同声：“请多指教！”
学院长拍了拍手，几名穿着忍者服的学员立刻出现。“带这几位去换训练服。”他转向小智一行人，“小刚和小优，
你们可以去东院的培育区，那里有适合饲育家的课程。小智，你和你的宝可梦们去西院的对战区如何？”
“太棒了！”小智握紧拳头，“皮卡丘，我们要大干一场了！”
“皮卡皮！（全力以赴！）”皮卡丘竖起耳朵，脸颊的电囊冒出细小的电光。
换好训练服后，小智带着他的宝可梦们来到了西院。这是一个半露天的训练场，四周竖立着各种木桩、绳网和移动靶。
“菊颗！（这里好酷！）”菊草叶好奇地打量着四周。
“瓦尼瓦尼！（看那个旋转的木桩！）”小锯鳄兴奋地指着场地中央的装置。
一位戴着面罩的教官走过来：“你就是小智吧？学院长特别交代要好好你。”虽然看不见表情，但小智能感觉到他在笑。
“求之不得！”小智拍了拍胸脯，“我和我的伙伴们随时可以开始！”
教官点点头：“很好。第一项训练：反应速度。你的宝可梦需要躲避这些——”他打了个响指，数十个手里剑形状的飞盘从四面八方射来。
“大家小心！”小智立刻喊道，“皮卡丘，用电光一闪引导大家！”
“皮卡！（跟我来！）”皮卡丘化作一道白光，在飞盘中穿梭。其他宝可梦紧随其后，灵活地躲避着攻击。
“菊颗！（左边有空隙！）”菊草叶一个翻滚，躲过三个飞盘。
“西农！（上面！）”火球鼠喷出一串火花，将头顶的飞盘击落。
幼基拉斯站在原地没动，飞盘打在它身上发出“叮叮”的声响。“基拉...（不痛...）”它歪着头，似乎很困惑为什么要躲。
小智哭笑不得：“幼基拉斯，你的防御是很强，但也要练习躲避啊！”
训练持续了整整一小时，宝可梦们渐渐掌握了节奏，能够完美避开所有攻击。教官满意地点头：“不错，比我想象的要快。接下来是实战训练。”
他放出三只宝可梦：一只飞天螳螂、一只铁面忍者和一只脱壳忍者。“选择你的对手吧。”
小智思考片刻：“菊草叶，你想试试吗？”
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