这是因为，青藏高原地理条件太过恶劣，地产瘠薄，汉人极难适应当地的气候条件，故难以在此定居。而这些地方，也不可能成为无人居住蛮荒之地，故也不好将当地土着迁走。
所以，去除其原有权贵，就地加以教化，当为最佳之策。
而唐军这般声势浩大来攻，各地的头人与土司，在纷纷瓦解之时，亦在不停派出使者，向拉萨求援。
这时的西藏，其名义上的统治者，是固始汗，孛儿只斤.图鲁拜琥。
这位乌思藏统治者，也译为顾始汗，是明末清初卫拉特(厄鲁特蒙古)所属的和硕特部首领、卫拉特盟主、青藏高原和硕特汗国(清朝属国)的创建者，姓孛儿只斤，本名图鲁拜琥(Tho-rol-pa'i-hur)，为成吉思汗之弟哈布图哈萨尔十九世孙，其祖上，则是世代为厄鲁特盟主。
此人在历史上，是青藏高原历史的转折性超级人物。他应西藏黄教摄政者索南群培和五世达赖、四世班禅邀请入藏救助黄教，路上推翻了青海和康巴的政权，1642年入藏推翻了噶玛噶举派的藏巴汗王国，建立新一代和硕特汗国及里面的甘丹颇章(行政型)政府，确立新兴教派格鲁派诸领袖在西藏的领导地位，重建布达拉宫及扩建大昭寺，使达赖驻锡重建的布达拉宫、使班禅驻锡扎什伦布寺，影响了西藏数百年历史。
真实历史上，此人也是个颇有谋略，又胆大心细的人物。
他于崇祯八年，乔装改扮成朝佛的香客，从新疆途经青海进藏作实地调查，侦知敌情。正好遇到却图汗儿子阿尔斯兰率领的一万蒙古骑兵向西藏进发，准备去援助藏巴汗，消灭格鲁派。顾实汗与阿尔斯兰同行相走。一路上，顾实汗说服阿尔斯兰不要敌视黄教，阿尔斯兰改变了态度。他率领的蒙古骑兵聆听了五世达赖喇嘛阿旺罗桑嘉措的讲经说法，最终，阿尔斯兰的行为被噶玛噶举派告到却图汗处，却图汗恼怒不已，遂命部将暗杀了阿尔斯兰。
装扮成香客的顾实汗一行平安抵拉萨。崇祯九年，达赖赠给顾实汗“丹增却杰“(意为持教法王)称号。顾实汗与五世达赖、四世班禅秘密商议，决定由顾实汗率大军从新疆前来青海，称消灭却图汗，再消灭白利土司顿月多吉，继而进军西藏消灭第悉藏巴。
第二年，顾实汗率领本部人马，加上巴图尔珲台吉的部分准噶尔军队，进入青海境内。战役在大小乌兰和硕(今刚察县境内)之间进行。结果，顾实汗以少胜多，大败却图汗，并擒杀却图汗。这场战斗在青海历史上称为“血山之战“。
顾实汗于第二年五月进攻孜一带消灭白利土司。战争持续一年后，顾实汗占领了白利土司统治的全部地区，今四川北部的德格、甘孜、邓柯、白玉、石渠、玛尔康等部落，都成为和硕特蒙古的统治区，顾实汗俘虏并处死了顿月多吉，释放了被白利土司关在监狱里的格鲁派、萨迦派等所有喇嘛。由此，顾实汗得到了西藏各教派(除苯教)全体喇嘛的钦佩和感激。
顾实汗顺利地消灭了却图汗、白利土司两个敌人后，第悉藏巴便成为他的最后进攻目标。
崇祯十四年，顾实汗出其不意，奇兵入藏，先占领前藏大部分地区，藏巴汗率领残部退守后藏，顾实汗乘胜进军，活擒噶玛·丹迥旺波，将这位一贯反黄教的首领按照处死蒙古贵族习俗装入牛皮袋里，投入湍急的雅鲁藏布江中。统治西藏地方约24年(1618--1642)的噶举噶玛政权正式结束，使格鲁派摆脱了危局。格鲁派集团在顾实汗的支持下取得了巨大胜利，在宗教势力上、经济实力上占据绝对优势。固始汗也因此统治了整个青藏高原。
这场战斗下来，图鲁拜琥终于攻服了西藏大部，正式成了西藏的最高统治者。
只不过，他的统治范围，在明朝灭亡后，由于没有宗主国的支援，图鲁拜琥受到了极大削弱，除了拉萨一带外的本部势力，其余各地，基本处于自治状态。甚至北面的叶尔羌汁国与准噶尔汗国，也常常会打乌思藏的主意，让图鲁拜琥郁闷不已。
不过，对于这个的结果，他还能勉强忍受，毕竟这样的小打小闹与小规模的各地自治，还未能影响到他的统治基础。而现在，唐军这般大举来攻，图鲁拜琥终于知道，自已最大最危险的对手，终于到来了。
拉萨皇宫大厅，图鲁拜琥与一众大臣以及子侄，环席而坐，共议时事。
这席上，那五世达赖，以及图鲁拜琥任命的管理行政事务的第巴索南群培，因是外臣，都起身向图鲁拜琥起身致敬，顾始汗亦一一微笑回礼。
图鲁拜琥环视众人，忍不住一声长叹：“唉，现在唐军陈兵乌思藏两端，一同对我乌思藏用兵，现在其进度虽是不快，但这般下去，只恐终有一日，要攻到拉萨城下。本王心下甚忧之！意欲用兵漠西。准噶尔汗王请我们兵天山，一同对抗汉军，诸位，你们觉得我们该如何应对？”
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