他吸收了中国原始儒学中的“德政”思想，提出了“皇天无亲，惟德是辅”的进步天命观。
他对文馆诸臣说：“见史臣称其君者，无论有道无道，概曰天子。殊不知皇天无亲，惟德是辅，必有德者，乃克副天子之称。今朕承天佑，为国之主，岂敢遂以为天子，为天所亲爱乎？倘不行善道，不体天心，则天命靡常，宁足恃耶。朕惟有朝乾夕惕，以仰邀天鉴而已。”
皇太极认为“皇天无亲，惟德是辅”，只有“体天心”“行善道”的“有德者”才配得上天子之称。
战略思想上，皇太极在国力较弱之时，曾采取对明暂时议和，以争取时间的战略。
但大臣们都知悉入关夺取明政权是皇太极的夙愿；即所谓“皇上志在中原”。
天聪元年，明天启七年，1627年，后金与明的宁锦之战，大小数十次，后金以失败告终。
是年，因朝鲜李倧政权采取敌视后金之策，刚刚继位的皇太极，即命阿敏等攻打皮岛的毛文龙，顺击李氏政权；直至李倧请和。
但此时的后金与努尔哈赤之时已不同，后金势力已经壮大，并不惧怕李氏政权从后方对其攻击。
故皇太极要采取的是进攻战略。
但皇太极的决定却遭到贝勒们的反对；故后金统治集团内部战略思想出现争议。
皇太极是通过盛京君臣大讨论，对明、蒙、朝三大敌方势力进行战略判断，并及时地对原有判断作出调整。
皇太极最终战略目标是明朝，攻明战略是指导战争全局的原则性、纲领性任务。
但贝勒们的“共识”中'有一个“隐患”，就是太过轻松地估计了对明作战；没有深刻地考虑到对明作战的旷日持久；这一点只有皇太极有思想准备。
在总的战略之中，根据战局发展，突然派兵征伐李倧，解决后顾之忧。
而从天聪年间起，四次入关征明，也证实了要灭明是需要一些时间的。
这正如皇太极的伐大木理论所言：取燕京如伐大树，需要从两旁斫削，则大树自仆。
明朝虽已腐朽不堪，但作为一株百年大树，尚未达到自仆的程度。
而先解决李氏政权这个后顾之忧，无疑会为后金增加新的人力、物力；更重要的是没有了后顾之忧。
而后崇德年间迫使李氏政权臣服，确实证实了皇太极这一战略思想的正确。
皇太极从天助神佑的天命观出发，强调“用兵征伐，有道者，蒙天佑；无道者，被天谴”。
皇太极认为自恃其力，恣行杀夺，人心未合，必然失败；力行仁义，勤治农桑，发展经济，扩充实力，争取民心，就能立于不败之地。积极发展军事力量，先后组建蒙古八旗、汉军八旗，完善了八旗兵制。
要求部队严格训练，“操演娴熟”。
在保持和发展八旗兵骑射长技的同时，重视采用先进的军事技术，利用汉人工匠制造红衣炮，组建炮兵部队，增强战斗力。
治国治军，主张以人才为本，不论民族、资历，惟才是用。
以“满汉一体”为号召，争取汉人支持，重用汉人降臣降将，以汉治汉。继承努尔哈赤“伐大木”的战略思想，并根据后金“家邦未固”、“四境逼处，素皆不协”的内外形势，进一步确定了先征服弱小之敌，拆散敌人之间的联盟，解除后顾之忧，尔后集中力量攻击强敌，统一天下的战略方针。
改变努尔哈赤单纯依赖武力连续攻明的战略，采取讲和与自固的灵活政策，以达到麻痹敌人，争取民心，赢得时间，壮大自己的目的。
皇太极五次派兵避开明朝坚固的正面防线，绕道入关，深入京畿，不断削弱明朝实力，改变了双方力量对比，为最后决战的胜利创造了条件。
在作战上，皇太极善于根据不同的作战对象，采取不同的战法和策略。
大军压境，速战速决；掘壕筑墙，久困长围，围点打援；武力征讨与政治招抚相结合，成功地指导了对朝鲜、漠南蒙古和明朝的战争。
皇太极的军事思想，吸收了中原汉族军事文化，丰富和发展了满族的军事思想，在清代前期有重大影响。
比起韦宝这个真正的重生穿越巨，皇太极也很像是一个穿越来的人，他总是能保持冷静的头脑，很少犯错。
“聪古伦，我来告诉你为什么不能向韦宝求救。先不说我们与宝军的仇恨，单说宝军，与明军是不同的，我们可以和大明暂时议和，但绝不能与宝军议和！因为大明大，在他们眼中，我们大金国是很小的，小的像是一股山贼！而在宝军眼里，我们是两颗并肩长成的大树，不管是他的壮大，还是我们的壮大，都一定会对对方有很大的影响，所以，我们不可能与宝军议和。”皇太极道。
“可父汗的病怎么办？难道父汗对我大金国不重要吗？”聪古伦格格生气道。聪古伦实在想不到，居然是皇太极带头反对向宝军求救。
莽古尔泰道：“我也不赞同向宝军求药，但我曾经被宝军俘虏过，我不得不说，宝军的药是有效的，很神奇，我上回受了很重的枪伤，还有之前的毒疽之毒，宝军不用数日，帮我一并治好了，我原本还以为我肯定死定了。”
众人都对莽古尔泰的话很疑惑，都暗忖，你这到底是让向宝军求药，还是不让向宝军求药？
“父汗的伤势要紧，现在到了危机关头，也顾不上这么多了，还是大家举手议事吧！”代善这时候少有的露出决断，举手道：“赞同向宝军求药的举手！”
在场的建奴将领们互相看了看，都很迟疑。
除了代善，只有聪古伦格格立刻举手跟随，此外还有几名年幼的贝子。
莽古尔泰犹豫了一会儿之后，举手了。
莽古尔泰这一下举手至关重要，立刻有多名将领跟着举手。
这一下，举手的人和不举手的人就看上去差不多了，目测很难分出哪一边人多，哪一边人少。
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