押解专机顺利抵达东京羽田机场，乌丸莲耶被严密押解下飞机，送上前往警视厅特殊监狱的囚车。沿途街道上，不少民众自发前来围观，挥舞着“正义必胜”的标语，掌声与欢呼声此起彼伏。少年侦探团的孩子们站在人群中，元太举着画着侦探徽章的牌子，兴奋地大喊：“柯南，我们赢啦！”柯南笑着挥手，眼中满是释然。
警视厅内，乌丸莲耶的审讯工作正式启动。技术人员通过他身上搜出的加密硬盘，进一步破解了组织的核心秘密，确认了乌丸莲耶利用APTX4869衍生药物维持生命的真相，以及组织多年来操控全球部分产业的犯罪证据。这些证据将作为起诉乌丸莲耶及其他核心成员的关键依据，国际刑警已启动全球范围内的司法协作程序，确保所有罪犯都能受到法律的制裁。
傍晚时分，全球范围内的残余势力肃清工作全部完成，国际刑警传来最终通报：“组织的所有已知势力已被彻底瓦解，未发现任何遗漏的据点或成员。”沈慕将第三卷的所有资料整理归档，最后一份卷宗的封面印着“第三卷：正义昭彰，黑网终破”。柯南拿起卷宗，感慨道：“从最初遇到黑衣组织，到现在彻底瓦解他们的核心势力，我们走了很长的路，但一切都值得。”
FBI安全屋的楼顶，沈慕、柯南、赤井秀一、安室透站在一起，望着夕阳下的米花町。金色的余晖洒在城市的街道上，温暖而宁静。通讯器里传来各方队员的祝福消息，所有人都在为这场胜利欢呼。“第三卷结束了，但我们的责任还没结束。”沈慕看着远方，语气坚定，“未来还会有新的犯罪挑战，我们需要带着第三卷的经验与默契，继续守护这份安宁。”
夕阳渐渐落下，夜幕笼罩大地，米花町的灯光次第亮起，如同繁星点缀。第三卷的帷幕在正义的欢呼声中正式落下，这场跨越全球的追缉之战，最终以邪恶的覆灭、正义的胜利画上圆满句点。而属于他们的全新征程，也将在这份安宁与默契中，缓缓开启。
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